fm20101030(整理笔记国家计量技术规范 03聚合酶链反应分析仪校准规范)

JJF 1527-2015 聚合酶链反应分析仪校准规范(已发布实施)

1. 引言参考的相关标准:JJF 1030 - 2010 《恒温槽校准规范》SN/T 2102.1 - 2008 / ISO 22174: 2005《食源性病原体PCR检测技术规范 第1部分 : 通用要求及定义》SN/T 2102.2 - 2008/ ISO 20836: 2005《食源性病原体PCR检测技术规范 第2部分: PCR性能试验要求》YY/T 1173 - 2010《聚合酶链反应分析仪》GB/T 6682 - 2008《分析实验室用水国家标准》

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2. 范围适用于模块加热的聚合酶链反应( PCR )分析仪计量性能的校准,对于其他类型的 PCR 仪,可参照本规范执行。

3. 术语3.1 聚合酶链反应一种对特定的DNA或RNA片段在体外进行快速扩增的方法,由变性——退火——延伸三个基本反应步骤构成。PS:(90~95)℃变性;(40 ~60)℃退火;(70~75)℃延伸。不完全参照此温度。温度过高,会对酶活性有影响。因此,温度过冲不可太高。

3.2 聚合酶链反应分析仪基于PCR技术原理,模拟DNA或RNA的复制过程,在模板、引物、聚合酶等存在的条件下,特异扩增已知序列,对其进行检测分析的仪器设备。

4. 概述聚合酶链反应分析仪是基于PCR技术原理,模拟DNA或RNA的复制过程,在模板、引物、聚合酶等存在的条件下,特异扩增已知序列,对其进行检测分析的仪器设备,包括定性PCR仪和定量PCR仪两类。定性PCR通常由样品载台、热循环部件、控制部件和电源部件等部分组成。定量PCR仪主要由样品载台、热循环部件、控制部件、光学检测部件、电源部件、计算机及应用软件等部分组成。PS:目前PCR的分类可能有3种。①PCR :即普通PCR,只有温度功能,无实时荧光定量功能。对应此规范提及的定性PCR②qPCR : Quantitative Real-time PCR ,实时荧光定量PCR,对应此规范所提及的定量PCR(此规范的标物制备中,提及的也是加入荧光探针)③dPCR : Digital PCR,数字PCR, 可直接输出DNA分子的个数,绝对定量。(目前在国家计量技术规范全文公告系统还没有查到数字PCR)

5. 计量特性简单的说,如果定量的,就需要做样本相关的项目。

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6. 校准条件仪器使用允许的环境条件,测量过程中应测量和记录环境的温度、相对湿度。6.1 校准设备及标准物质6.1.1 温度校准装置由若干个(通常为15个)精密温度传感器、数据采集分析模块组成,测量范围(0-120)℃,温度校准装置测量不确定度≤0.1 ℃,且需要通过计量检定。

6.1.2 标准物质校准时应采用国内外有证标准物质,包括:质粒DNA标准物质、核糖核酸标准物质,其特性量值(拷贝数≥10^910910^9109copies/μL),相对扩展不确定度≤5 %。

6.1.3 电子天平精度≤0.01 mg,且需要通过计量检定。

6.1.4 移液器规格:2 μL、10 μL、100 μL、200 μL、1000 μL,且需要通过计量检定。校准前按照附录A配置校准时使用的溶液。

7. 校准项目和校准方法7.1 校准条件校准前需将PCR仪开机预热30 min。

7.2 温度示值误差、温度均匀性校准7.2.1 将PCR仪及温度校准装置各部件连接完好,在温度传感器表面上涂抹适量的导热油,按图1所示将温度传感器置于PCR仪(96孔)加热模块设定孔中,其他型号的PCR仪可参照图1进行测试。

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7.2.2 参照送校单位提供的PCR仪说明书设定温度控制程序,如表2所示,不能设定30 ℃为温控程序起点的PCR仪,温控程序参照表2进行设定。

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7.2.3 启动温度校准装置,记录整个数据采集过程并保存。7.2.4 温度示值误差校准结果按公式(1)和公式(2)计算:绝对误差

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7.2.5 温度均匀度校准结果按公式(3)计算:最大值 - 最小值

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7.3 升降温速率校准7.3.1 参照送校单位提供的PCR仪说明书设定该PCR仪的温度控制程序,如表3所示。启动温度校准装置,记录整个数据采集过程并保存。

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7.3.2 记录仪器显示温度达到设定温度恒温10 s后,取50 ℃温度点TA和90 ℃温度点TB,这中间的时间为t。

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PS:在计算平均降温速率时,规范中所给出来的对应关系,存在了冲突的地方。即最终导致计算出来的速率是正的还是负的。

7.4 定量PCR仪样本示值误差、样本线性的校准7.4.1 标准物质的配制详见附录A

7.4.2 校准板的制备用经过计量校准的移液器,将配制好的PCR 反应体系加入到反应板中,按图所示准备96孔校准板,其他型号的仪器可参照本示例准备。

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PCR 反应体系的配制方法见附录B

7.4.3 参照送校单位提供的PCR仪说明书设定该PCR仪的温度控制程序,如表4所示。

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7.4.4 分析参数的设置参照送校单位提供的PCR仪说明书设定PCR仪的数据分析参数。

7.4.5 样本示值误差按绝对误差计算。

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PS:此项没有描述要取多少次测量值的平均值,但在附录E 校准原始记录参考格式中,里面体现的是10次测量值。

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7.4.6 样本线性以系列稀释的标准物质(至少5个)扩增Ct值与浓度对数值进行线性回归,计算其线性回归系数r。PS:注意是用浓度对数值进行计算线性回归。

8. 复校时间间隔建议不超过1年

9. 附录A 标准物质的准备及配制1. 试剂质粒DNA标准物质或核糖核酸标准物质其特性量值(拷贝数≥10^910910^9109copies/μL,相对扩展不确定度≤5 %)满足校准需求,水为符合 GB/T 6682 - 2008 规定的一级水。

2. 仪器电子天平,精度≤0.01 mg;移液器,规格:100 μL,1000 μL,且需要通过计量检定。

3. 标准物质系列稀释配制将标准物质从 - 20 ℃冰箱中取出,置冰上溶解,然后室温平衡30 min。用经过高温高压灭菌处理的纯水进行稀释配制,并定为阴性对照样本。用电子天平配制系列稀释样品,其中S0位浓度为1×10^910910^9109 copies/μL的标准物质,S1、S2、S3、S4、S5、S6、S7为S0系列稀释后的样品,每步样品配制后要充分震荡混匀,详细配制方法见下表。

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4. 未知样品的配制以配制好的S3为起点,用经过校准的天平(0.01 mg)配制未知样品1(U1)和未知样品2(U2),样品配制后要充分震荡混匀,详细配制方法如下表。

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10. 附录B PCR反应体系的配制1. 试剂ddH20 —— 灭菌双蒸水10 × PCR buffer25 mmol/L MgCl2dNTPs —— 四种脱氧核糖核苷-磷酸混合物10 μmol/L Probe —— 荧光标记探针10 μmol/L Primer 1 —— 引物110 μmol/L Primer 2 —— 引物25 U /μL Taq enzyme —— 热启动酶DNA

2. 仪器移液器,规格:2 μL、10 μL、100 μL、200 μL、1000 μL,且需要通过计量检定。

3. PCR反应体系的配制参照下表

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